¿Por que en las creencias de casi todas las culturas humanas se afirmaba que en los lugares desiertos había espíritus?

Son lugares solitarios, causan temor. Por eso se consideran habitados por espíritus. Como las casas abandonadas, los lugares oscuros, etc

Bueno, en los desiertos, en las cuevas, en los ríos, en los montes, en todos lados. No tienes más que fijarte en la mitología griega, que tenía dioses, ninfas, sirenas y toda clase de seres fantasiosos para cada una de las cosas que hubiese menester.

Hay espíritus en todo el orbe terrestre e incluso todo el universo.. sólo lo observan quienes tienen las distintas mediumnidades que le permite la visualización o percepción de el mundo espiritual.. incluso todo el universo es de ése origen, el espiritual...

Por el temor a estar en aquellos sitios. Miedo.

Ignorancia