o que acontece com aquelas enormes estruturas de combustivel das naves espaciais...?

Parece que são abandonadas no espaço (viram o lixo espacial).

Entram em órbita, como se fossem satélites e, com o passar do tempo, podem entrar na atmosfera terrestre, quando são destruídas em parte e, o que sobra, caem no planeta, como se fossem meteoritos.

No caso do ônibus espacial, os foguetes de combustível sólido, que terminam a queima mais cedo, caem no oceano Atlântico. O grande tanque marrom vai até o espaço e depois é descartado caindo e se incinerando na reentrada.

http://pt.wikipedia.org/wiki/%C3%94nibus_Espacial (leia no tópico "Lançamento")

Informações mais detalhadas:

http://science.ksc.nasa.gov/shuttle/technology/sts... (tanque externo)

http://science.ksc.nasa.gov/shuttle/technology/sts... (booster de combustível sólido)

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Se você está falando dos Onibus Espaciais, acredito que aquele tanque é reaproveitado depois...